中國9月開始開放港澳台居民居住證申請，開放申請至今僅不到2周的時間，國台辦方面宣稱，已經有超過2萬餘名台灣人申領居住證。然而，陸委會方面研擬修法增訂條例，要求申領居住證的台灣人須向主管機關申報登記，否則將面臨罰緩。
陸委會擬修法要求申辦居住證者申辦登記
陸委會方面考量台灣人赴中工作或求學需求，可能會基於生活方便而申辦居住證，但仍認為，中國居住證是中國透過經濟、社會融合，企圖削弱中華民國主權的統戰作為，因此研擬修訂《兩岸人民關係條例》，採取申報登記制，讓配套措施更完備。
另一方面，根據《兩岸人民關係條例》第9-1條規定，台灣地區人民不得在中國地區設有戶籍或領用護照，若違反規定，除經有關機關認有特殊考量必要外，喪失臺灣地區人民身分及其在臺灣地區選舉、罷免、創制、複決、擔任軍職、公職及其他以在臺灣地區設有戶籍所衍生相關權利，並由戶政機關註銷其台灣地區之戶籍登記。
對此，陸委會指出，由於中國居住證申辦規定並不包括要在中國入籍，因此台灣人申辦中國居住證不會違反兩岸條例，也就是說，台人申領居住證並沒有除籍疑慮。
強制將申辦居住證台人除籍？
雖然陸委會的態度是如此，但已經有立委研擬提案修兩岸條例，讓有申辦中國居住證的台灣人註銷在台戶籍。目前已有包括民進黨立委王定宇提出相關修法法案，並已完成連署，只是，他憂心法案會讓台商及在中國的台灣人變成夾心餅乾，也怕影響國安及國家忠誠度上的平衡，因此還要與行政部門討論後，才會決定是否提出。
除了王定宇外，時代力量黨團也有同樣的修法提案，黨團總召徐永明指出，除了要求強制登記外，也應該修法將申領居住證者凍結戶籍或除籍，不過，這部分同樣也得再拜訪陸委會及與行政機關討論。
由於按照兩岸條例來看，申辦居住證者確實沒有違反規定，不會有註銷台灣戶籍的問題產生，如果用強硬手段除籍，恐怕會面臨相當大的爭議，包括政府可能被除籍者提告，因而需打憲法官司，甚至會讓在中國的台灣人變成兩岸人球，因此政府在此議題上的處理不得不慎；陸委會方面目前已預定在14日，與執政黨團討論攸關中國核發港澳台居住證的相關因應作為。
面臨課稅問題和是否持有居住證無直接關聯
而除了相關因應作為，陸委會早在先前就不斷提醒，申領居住證可能增加稅務、社保方面之負擔。但國台辦方面則不斷強調，港澳台居住證申領辦法和相關稅收規定沒有對應關係，也就是台灣民眾不會因申領居住證而改變在中國的納稅身份與義務，也不會被要求負有全球所得納稅義務。
事實上，按照《港澳台居民居住證申領發放辦法》，台灣居民在中國居住半年以上，符合有合法穩定就業、合法穩定住所、連續就讀條件之一的都可以申領。回過頭看中國將在明年起實施的《個人所得稅法修正草案》，當中明定，依循國際慣例採居民個人與非居民個人概念，課稅身分從現行的住滿1年，改為有住所，或無住所但1年內住滿183天，在中國境內外的所得均須申報所得稅。
換句話說，按照中國新修訂的個人所得稅法規定，基本上只要居住滿183天就得依規定納稅，對於在中國長期工作的台商而言，只要會待超過183天以上，即便沒有申辦居住證，也符合繳稅義務。
