距離10月21日普悠瑪列車事故已經過兩個月，持續追蹤後續事故調查報告的社會大眾、家屬、立委、學者等最不滿的地方，或許就是政府整個後續處理的方式與態度。
「我對於行政院發生這麼大悲劇以後，竟然還用擠牙膏式、充滿政治處理的方式在處理這份報告，我完全無法解受。」時代力量立委黃國昌憤怒地批評。這場發生在九合一大選前一個月，造成旅客18人死亡、267人受傷的重大公案意外，除了揭露赤裸裸的政治操作以外，也點出台鐵最大問題——後勤管理系統的崩解。
說詞反覆、一問三不知的台鐵
這場震驚國內外的事故發生後，在社會大眾要求「真相」的壓力下，行政院長賴清德向大家保證一個月內會提出完整的調查報告，由政委吳澤成親自擔任召集人，與15位專家組成「1021鐵路事故行政調查小組」。
然而，台鐵於事發後一週內便頻召開記者會，不但經常一問三不知，無法說明清楚事故的細節爭議、說詞反覆以外，還不斷強調司機關閉列車自動防護系統（ATP）時並未通報、調度員不知情，列車才會失速釀成大錯，惹得社會大眾怒喊：「不要拿司機當替死鬼！」
像在擠牙膏的處理方式
後來台鐵、交通部在立法院被立委們輪番質詢下，尤其是黃國昌的一次次的爆料、打臉下，台鐵才承認列車自動防護系統（ATP）根本沒有與後端連線、該列車的煞車系統主風泵有異常、平時的維護系統沒做確實，真相才慢慢水落石出，顯示整個台鐵局的管理文化嚴重鬆散，乃至於到交通部、行政院的後續處理也不靠譜。
原本預計一個月內會提出完整調查報告，但因為選前時機敏感，最後延到選後才讓賴清德進行報告與質詢。只是，11月26日，調查小組提出的第一份報告，隨後就被黃國昌踢爆，點出主風泵異常是因為台鐵長年未進行維修、養護，裡面的濾網全是泥土、雜草，才會導致氣壓不足而動力異常，這些在第一份報告中都沒有提及。
12月21日，事故滿兩個月後，調查小組再提出第二份報告，厚達100多頁，內容就又依照黃國昌爆料的方向做調查，最後做出結論會改善組織、設備、程序、人員及環境5大層面的缺失，但整體政府的調查過程給社會感覺不專業，也沒有誠意。
台鐵最優先得改革的是「組織文化」
「車子從買來，遠端檢視系統、主風泵、後勤支援管理系統，這些通通都沒有，納稅人的錢一塊都沒少給你們，結果呢？我們花的錢通通沒有發揮作用。」黃國昌質問政府與台鐵。事實上，行政院的第二份報告也有點出，台鐵中「運、工、機、電」各行其事的組織文化與模式，顯示政府現在也知道，台鐵內部組織鬆散，對列車的安全檢查的態度不夠嚴謹，才會釀成大錯。若持續用這種方式與態度在營運台鐵，那麼可預期的未來，就可能會再發生一模一樣的悲劇。
現在看到政府提出一堆台鐵改革的建議，但具體要怎麼落實這才是問題。台鐵是個龐大的組織，長年累積下來的組織文化有優點，也有缺點，這些缺點與陋習都是現在政府、台鐵要去面對的。「報告沒有清楚點出結構性問題，很可惜，每一次事故都是慘痛的經驗，而不是教訓，台灣心裡很容易忘記這些傷痛。」災害風險管理學者、銘傳大學建築系教授王价巨直言，「現在選後政府高層感覺也是一團混亂，找到的專家也是針對車輛、設備進行檢討，但組織文化檢討不明顯。」
新上任的台鐵局局長張政源現在喊出「安全比準點重要」的口號，對此，王价巨認為雖然這是好的，「但其實這兩個都是台鐵的責任。」普悠瑪列車故事給台鐵多少衝擊，有沒有轉化為內部檢討的動力很重要。「台灣鐵道系統要有一個更上位的規劃，除了東半部另當別論，現在西半部已經有高鐵，台鐵最賺錢的或許是區間車系統，那麼台鐵的定位為何？」王价巨表示，鐵道局要有更全面的盤點與規劃，其中組織文化可能就是台鐵得最優先改革的地方。
