台大管案看似落幕，實際上卻是爭議開始滾雪球。
教育部長葉俊榮突然放行管案後飽受批判，府院黨都表態對葉俊榮的決定感到「錯愕」，甚至諸多綠委及行政院秘書長卓榮泰都跳出來齊聲批判、咎責，葉俊榮旋即為此請辭下台，成了第3位因管案下台的教育部長，但事件全劇終了嗎？似乎還沒。
府院錯愕但其實「默許」葉俊榮的決定？
先從總統府25日發出的聲明來看，就能嗅出一些端倪。總統府發言人林鶴明25日提到，針對管案，總統蔡英文與前立法院長王金平曾經會面，另外還有一次是總統府秘書長陳菊與蔡英文、王金平3人的會面，但最後雙方各自堅持立場，會談不歡而散。
不僅總統府在管案中的角色讓外界產生疑慮，更是有綠營人士指出，台大管案爭議對民進黨而言始終是顆政治炸彈，在九合一大選後，葉俊榮曾向總統府表達想直接處理管案的態度，蔡英文則抱持依循管案訴願結果，以法律程序處理的立場，也因此，對於葉俊榮突然「拆彈」，確實不免有些措手不及。
不過，值得注意的是，葉俊榮在開記者會前先告知行政院長賴清德，而賴清德也第一時間轉告蔡英文，據媒體報導，即便葉俊榮僅告知要對管案做出新決定、要來處理管案，賴清德應該也能猜到葉俊榮所謂的決定為何，倘若府院覺得不妥，應該都還來得及阻止。
然而，也有綠營幕僚透露，其實民進黨高層對於管案的態度，已經是抱持著放行的態度，只是沒人敢開第一槍。而在葉俊榮放行管案並火速請辭後，外界好奇，這會否讓教育部的決定翻案，卓榮泰表示，公文已經行文台大，往後看不到任何理由或狀況，改變教育部勉予同意管中閔上任的決定。
葉俊榮自拆炸彈，替綠營清戰場
但就有台大教授質疑，基本上，就法學而言，上級機關是可以撤銷下級機關的決定，公文已經發出或許不成理由，且葉俊榮召開記者會的時間點是在24日，公文則是在25日才發到台大，這中間其實還有時間可以撤回，但行政院卻未阻擋。
且管案爭議如此大，府院也都不斷強調，「事關重大」，要審慎處理。因此，今天教育部對於管案的處理，不大可能單憑葉俊榮一個人的意志，就能做出決定，勢必有得到高層認可才動作，事件爆發後蔡英文雖然錯愕，但不可能不知情，且以府院都藉此放行讓管上任來看，應是高層默許這項決定。
就連被點名居中協調處理管案的前民進黨主席施明德都直言，如果沒有更高層點頭，葉俊榮做出這個決定的可能性不大。
再加上，在民進黨九合一大選潰敗後，內閣總辭幾乎已成定局，時間點可能就落在明年1月立法院總預算案結束後，也就是說，內閣明年1月就要進行全面改組，葉俊榮也只是提前下台而已。而過去葉俊榮卸下內政部長職務後，直接轉任教育部長，某種程度上來看，就是要來接手處理管案，如今他選擇自行拆除政治炸彈，替綠營清理戰場，對後果大概也早已料到。
管案落幕了嗎？
只是，在葉俊榮引信自爆後，管中閔將在明年1月8日上任，但各界對此的批判及質疑聲浪依然洶湧。台大法律系榮譽教授賀德芬痛批，教育部勉予同意管案等於讓校譽毀於一旦，因而發起罷免蔡英文行動；台大校長候選人之一的吳瑞北則向台北高等行政法院，聲請定暫時狀態假處分，防止管中閔上任。
依照規定，透過法院聲請假處分若獲准，可暫時阻止管中閔上任，而雖然法律上無明定法院須在多久時間內，做出裁定，但因管案備受矚目，法院已經火速訂定在27日上午開庭。教育部法制處處長李嵩茂26日在立法院教育委員會中指出，假處分是否做成要等法院審議後，才會裁定，教育部則會尊重裁定內容。
另一方面，管中閔身上背負的爭議除了先前的違法赴中兼職外，現在又被爆出過去擔任公職期間，曾以不具名方式在某週刊寫專欄，取得高額稿費，且監察院初步認定管中閔違法兼職，不排除提案彈劾。
而對於外界關切，這項爭議是否可能影響管中閔任台大校長，教育部常次林騰蛟表示，若校長有違法相關規定，台大方面也對適性有質疑，應該去做調查，並對外說明，教育部方面目前沒有收到相關檢舉，若有也會轉請校方處理。
教育部發聘管中閔任台大校長後，後續所延伸的相關法律爭議要遵照司法機關裁定，國民黨立委柯志恩指出，當教育部做出決定後，剩下的法律問題就是台大和當選人須自行面對。換句話說，這不僅等同於整個管案還沒落幕，更代表爭議雪球通通從教育部滾回台大及管中閔身上。
