蔡英文22日結束出訪行程返國，中午12點35分專機落地，卻在幾乎同一時間（12點20分）爆發執行總統專機任務的國安局侍從官吳宗憲與張恒嘉2位少校，涉嫌將走私的196箱共9800條香煙，藉由5輛停在機場國賓通道上的總統府貨車，準備跟著總統車隊一起離開。
結果在1點25分，被調查局與關務署的「聯合查緝小組」攔截，人贓俱獲。這不但讓蔡英文這次出訪的成果完全被轉移焦點，更被譏諷為「走私外交」，也讓反對黨批評蔡英文轄下的國安局瀕臨失控。
但蔡英文究竟事前是否知道此案，從23日媒體報導：「總統蔡英文22日得知本案後表示震怒，責令國安局進行行政調查，並配合司法單位偵辦」，她應該是不知情；而從蔡英文一回國所發表的講話來看，也應該是不知情，因為全沒提及此事。
「私菸案」是司法案件，卻可能直接影響總統安全
但是，當蔡英文專機11日出國時，調查局新北市調查處就已經接獲立委黃國昌的檢舉，稱有隨行人員，走私9200條高達新臺幣600餘萬的菸品。事實上，調查局有兩個身分，既負責犯罪調查，也負責情報蒐集，也就是必須提供層峰的預警情資。
而這個「私菸案」固然是司法案件，總統不能介入，但也是國安事件，因為當事人是總統出訪的隨從，直接影響總統的安全，如果吳宗憲知道事跡敗露，並有違法之虞，會不會跳機？因為他會被判軍法，終身俸沒了，這輩子也完了，甚至有可能變成尹清楓第二，成為長官的犧牲品；但如果他跳機，那可是讓國家顏面盡失的大事。甚至他會不會狗急跳牆，採取激烈行為？甚至危及總統的安全？
另一方面，蔡英文如果知道此「私菸案」粗略的情況，不涉及案件的細節，也可以在回國的機場講話大概陳述一下此案，例如說本次出訪隨員有人涉嫌違法，檢調單位將立即進行調查，表示她有掌握狀況。
呂文忠作為損害總統的安全與尊嚴
甚至她可以說這次出訪是「引蛇出洞」，將「國安走私集團」一網打盡，不但對自己沒傷，還得分。否則像這次，她在回國的機場講話大談外交突破，結果同一時間她的國安局隨員卻在大搞香菸走私，讓外界覺得被蒙在鼓裡，被質疑後知後覺，當然是顏面盡失。
但此「私菸案」情資為何蔡英文不知道？調查局局長呂文忠若怕洩密，可以直接向國安局局長呈報，彭勝竹應該不會洩密，難道呂文忠連彭勝竹也不相信？如果真的不相信，也可以直接與國安會秘書長李大維聯絡，為什麼都不做？這與偵查不公開無關，也無涉總統干預司法，而是確保總統的安全與聲譽。
難怪有媒體指出，在「私菸案」爆出前，總統府竟全無訊息，未來國安系統如何運作，讓人憂慮；報導還指法務部長蔡清祥、調查局長呂文忠事先毫無相關訊息。外界認為，蔡、呂兩人無法在第一時間掌握案情，顯示情治系統已經失靈，是蔡英文最應重視的國安危機。
蔡清祥24日說，這個「私菸案」，他維持「不指導、不干預、不介入個案」的「三不」原則，有媒體稱他「無法掌握」是不正確的說法，蔡清祥強調，自己並非在狀況外。至於呂文忠也被指射未掌握「私菸案」案情，蔡清祥表示，呂文忠是調查局長，對於部屬偵查的重大案件「當然會有一定程度了解與掌握」，媒體報導是對事實有所誤會。
選在總統專機抵達的當天「動手」目的究竟是？
呂文忠24日回應，無論此案是否有立案，基層是否有向他回報辦案進度，均屬「偵查不公開」，無法多作說明。
蔡清祥的說法表示他與呂文忠都知情，但這是真的嗎？那為何沒提醒蔡英文？還是他們兩人知道的不是全貌？所以覺得無足輕重？新北市調查處為何不申請搜索票？為何要選在總統專機抵達的當天「動手」？這些疑問，都有待釐清。
但是調查局作為情治單位，由純法律人的檢察官擔任局長，固然在依法行政上更為完善，但如果完全缺乏政治sense，恐怕無法發揮更多的功能。
