今年度的公費流感疫苗10月5日開打，不過才到第三天，7日台大醫院就已經發出公費成人流感疫苗已用罄的通知，北部各大醫院也在8日陸續發出即將用罄的公告，民眾接種疫苗的情形，比預計的還要熱烈許多。
流感疫苗熱門程度「史無前例」
台大醫院7日發出公費成人流感疫苗用罄公告，宣布即日起暫停接種服務，若有需要的民眾別白跑一趟，而衛生局緊急增加配送量到院，台大醫院又於8日上午公告，民眾下午門診可以繼續預約施打。
而8日陸陸續續有醫療院所開始貼出「疫苗用罄」的公告，林口長庚醫院剩不到800劑，淡水馬偕醫院、北醫附醫也宣布用罄，國泰及新光醫院也公布疫苗剩餘量不足，用罄即暫停施打，要民眾體諒，連部分診所也都表示，預計在今明兩日內用完所有疫苗，高雄市則是緊急依醫院分級實施限額施打，確保用量可撐到13日。
衛福部長陳時中在7日的指揮中心記者會中也提到，原先疾管署這邊是預計1個月打掉300萬劑左右，沒想到僅僅2天的時間，已經施打了85萬5592劑，以這速度繼續下去，肯定會更快打完，比照去年同樣天數的52萬4079劑，足足多了33萬劑，目前截至7日為止，已經施打126.3萬劑。
而這史無前例熱門的流感疫苗接種速度，真要拜疫情所賜。
受疫情影響，民眾擔心此時又得流感
今年公費流感疫苗共有603萬劑，自費部分有113萬劑，秋冬接近，許多國家開始又爆出新一波的武漢肺炎疫情，國內仍保持增加案例皆為境外移入，但民眾仍然不敢掉以輕心，尤其近來開始有秋天的涼意，擔心疫情尚未平息，又有流感來攪局，害怕此時有流感症狀，會被誤以為是武漢肺炎，因此今年接種疫苗的情形特別踴躍。
也不只是公費疫苗熱門，自費疫苗的部分，有小兒科醫師表示，許多都會區的醫療院所自費疫苗剛到貨，立刻在1天之內預約接種8成。
還有一大原因在於，今年首次出現有東洋製藥以細胞培養疫苗，雖然施打公費疫苗的民眾無法自行指定廠商，不過在自費的部分，對於對雞蛋過敏的民眾來說，可說是一大福音，因為過去的疫苗都是以雞蛋培養疫苗。
疾管署擬設專人專責處理該縣市疫苗調度
根據衛福部公布的公費疫苗對象，符合資格者共1600萬人，不過流感疫苗僅603萬劑，疾管署副署長莊人祥表示，疫苗通常都要提早向廠商預購，因此現在才要加訂是相當困難的，所以為了盡可能的讓流感疫苗分配均勻，不至於因為城鄉地區分配比例失衡，疾管署方面不排除設置專人處理該縣市疫苗調度事宜。
