本土COVID-19疫情趨緩，連一週零確診，不過今（6）日指揮中心指揮官陳時中在立法院證實，一名機組員在防疫旅館進行5天居家檢疫，期間採檢結果為陰性，10月5日再採呈陽性，Ct值為33，目前疫調進行中，暫列為境外移個案。機組員的2個小孩分別就讀台北市2間國小，校方也預防性停課，共56人受影響。
中央流行疫情指揮中心今日公布國內新增5例COVID-19確定病例，均為境外移入；另確診個案中無新增死亡。
指揮中心說明，今日新增5例境外移入個案，為1例男性、4例女性，年齡介於20多歲至40多歲，其中4例分別自美國（3例，案16373、案16374、案16376）、南非（案16375）入境，餘1例調查中（案16377），入境日介於今（2021）年9月14日至9月26日；詳如新聞稿附件。
指揮中心統計，截至目前國內累計3,507,972例新型冠狀病毒肺炎相關通報（含3,490,728例排除），其中16,267例確診，分別為1,632例境外移入，14,581例本土病例，36例敦睦艦隊、3例航空器感染、1例不明及14例調查中；另累計110例移除為空號。2020年起累計844例COVID-19死亡病例，其中832例本土，個案居住縣市分布為新北市412例、臺北市319例、基隆市29例、桃園市26例、彰化縣15例、新竹縣13例、臺中市5例、苗栗縣3例、宜蘭縣及花蓮縣各2例，臺東縣、雲林縣、臺南市、南投縣、高雄市及屏東縣各1例；另12例為境外移入。
指揮中心再次呼籲，民眾應落實手部衛生、咳嗽禮節及佩戴口罩等個人防護措施，減少不必要移動、活動或集會，避免出入人多擁擠的場所，或高感染傳播風險場域，並主動積極配合各項防疫措施，共同嚴守社區防線。
「COVID-19公費疫苗預約平臺」第11期預約將採分流方式進行，請符合預約資格民眾依分流期程預約
中央流行疫情指揮中心今（6）日表示，「COVID-19公費疫苗預約平臺」（https://1922.gov.tw/）已於今日中午12時停止意願登記進行結算，第11期預約將提供AZ疫苗第二劑及BNT疫苗第一劑接種，並採分流方式預約，相關說明如下:
一、 預約分流時間（本期預約提醒簡訊將於預約分流日前一天陸續發送，BNT：10月10日14時起、AZ：10月11日14時起）：
1. BNT第一劑：10月11日上午10時至10月13日中午12時。
2. AZ第二劑：10月12日上午10時至10月13日中午12時。
二、 施打期間：10月15日至10月21日。
三、 符合資格對象（於10月6日中午12時前完成意願登記）：
1. 7月22日（含）前已接種AZ第一劑之55歲至18歲民眾[即1966/1/1（含）-2003/10/15（含）前出生]，預約接種第二劑AZ疫苗。
2. 7月30日（含）前已接種AZ第一劑之56歲以上民眾[即1965/12/31（含）前出生]，預約接種第二劑AZ疫苗。
3.於10月6日前意願登記選擇BNT疫苗民眾之下列對象，接種第一劑：
（1） 47歲以上民眾[即1974/12/31（含）前出生]。
（2） 22-12歲民眾[即1999/1/1（含）-2009/10/15（含）間出生]。
（3） 18歲以上第9類對象[即2003/12/31（含）前出生]。
指揮中心說明，預約分流有助於讓預約過程更順暢，請符合上述預約資格民眾依期程分流進行預約。後續將視疫苗供應期程調整接種場次，籲請民眾屆時準時前往接種。另針對滿12歲至17歲（含）學生/青少年，請家長（監護人或關係人）於預約接種當日陪同學生/青少年至選擇之合約醫療院所或接種站，於現場簽署接種評估及意願書，完成COVID-19疫苗接種。
指揮中心提醒，10月1日起亦開始接種流感疫苗，依衛生福利部傳染病防治諮詢會預防接種組（ACIP）建議，接種流感疫苗應與COVID-19疫苗間隔至少7天，請民眾前往接種COVID-19第二劑疫苗前，應備妥「COVID-19疫苗接種紀錄卡」及健保卡，並於接種前評估時說明過往疫苗接種史，以利醫生評估。
