立法院5月9日上午三讀通過環境部組織法，要求行政院為了保護環境、辦理環境業務，將目前的環保署升級為環境部，還明訂了9大項業務，設立了4個次級機關。
全場無異議，三讀通過環境部組織法
立法院司法及法制委員會以及社會福利及衛生環境委員會，在3月22日召開聯席會議，並在當日初審通過了環境部組織法草案等案，但環保署正式升格成環境部後的名稱、掌理事項等關鍵條文保留，交由黨團協商。
5月3日立法院朝野黨團在協商後，保留條文全數達成共識； 5月9日全案於立法院會處理，在場出席立委並沒有提出異議，因此三讀通過。
掌理9項業務，新增4個次級機關，職員將破千人
會中明訂了未來環境部9大項掌理事項，包括環境部所屬機關辦理溫室氣體減量與氣候變遷調適、廢棄物清除處理、資源循環、化學物質管理、災害預防應變、環境管理及執法、土壤及地下水污染整治的督導、協調及推動。
此外，環境政策、制度的綜合規劃、法規研擬、推動及督導；環境檢驗測定；空氣品質保護、空氣污染防制；水體品質保護、飲用水水質管理；環境品質監測與預報的政策規劃、整合、推動、執行及督導等工作也都是未來環境部的業務範圍。
未來環境部將會由綜合規劃司、環境保護司、大氣環境司、水質保護司、監測資訊司等5個業務司，以及氣候變遷署、資源循環署、化學物質管理署、環境管理署等4個次級三級機關組成。
根據環境部組織法三讀通過條文，環境部部長會設置1人，特任；政務次長2人，職務比照簡任第14職等；常務次長1人，職務列簡任第14職等。目前環保署有職員743位，未來升級成環境部後將會有1007位職員。
張子敬：心情很激動，業務一定無縫接軌
環保署長張子敬對此事表示心情很激動，表示環境部是由環保署改制而成，工作上的變動會做到無縫接軌，也希望環境部能盡快在8月22日成立，因為環保署就是在1987年的8月22日成立的。
他也表示，環保署的升級是環保工作的一大步，因為這樣對於推動環境保護的修法及策略上都會有更大的空間，希望以此能有效的解決長期沒辦法解決的問題。
未來環境部成立後，會設立4署1院。分別是管理因應氣候變遷政策、溫室氣體的排放管理減量及交易、碳定價制度及氣候變遷調適事項的氣候變遷署；規劃與執行廢棄物源頭減量、資源回收與循環利用及事業廢棄物清除處理事項的資源循環署；規劃與執行化學物質管理及災害預防應變、環境用藥管理事項的化學物質管理署；規劃與執行環境管理與執法、一般廢棄物清除處理、土壤及地下水污染整治事項等的環境管理署；辦理環境研究、檢測、鑑識、 認證機構管理及人力發展業務的國家環境研究院。
關於國家環境研究院，張子敬表示，現在氣候變遷愈發嚴重，增加研究量能的工作迫在眉睫。國家環境研究院剛成立之時，會與中研院、氣象局、災害救治中心等其他研究機構攜手合作，與不同領域的專家一起擴增研究範圍。
