中科院網站8月28日遭到駭客入侵，中科院當時回應，初查非外力駭侵，國民黨籍立委王鴻薇踢爆，數發部回覆是遭「外部暴力破解登入」。中科院今（5）日再說明，為「境外IP破解，並觸發特定排程指令。」
國防部長顧立雄也證實，中科院採購資訊網的承包商管理介面，的確有被侵入情形，國防部已要求中科院全面檢討，並且要究責。
媒體傳出，調查局在8月底掌握中科院採購網系統遭駭客入侵，中科院稱是在測試系統，但調查局傾向認為與駭客有關，目前由台北市調查處立案調查。
軍事專家指出，中科院最新說法已經承認，這不是上次宣稱的AI演練出包，而是外部人士成功闖入系統，並且執行了正式指令。
專家以白話的方式指出，就是程式廠商在系統裡留了一扇沒有公開、沒有列管的「後門」，駭客找到這扇門、破解進入，還成功「按下按鈕。」
專家：廠商埋後門被駭客觸發，中科院長文解釋改口原因
因此在8月28日當天，中科院內部網路系統，對真實廠商狂寄逾200封信，他表示，「這就是被駭，不必再用一大串技術名詞包裝。」
中科院說明如下：
有關中科院8月28日「採購網大量派送過期採購資訊案」，中科院表示，經查察，中科院「採購資訊網」因原程式開發商為方便管理，內藏隱蔽排程管理介面，惟遭境外IP破解，並觸發特定排程指令，導致系統重新對合作供應商發送「詢價案件通知函」，該項缺失已經開發商確認，並立即完成改正。當日因中科院刻於該網測試區執行AI代理人訓練，故初始判斷以該測試為標的對外說明，惟經原採購網系統開發商提供完整報告後，始釐清肇因為廠商隱藏排程指令所致。
中科院進一步表示，為精進軟體供應鏈安全，中科院前於114年8月26日參考美方110年5月總統行政命令(EO)14028號公布之SBOM (Software Bill of Materials，軟體物料清單) 基本架構，令頒「軟體發展管理作業手冊」，明訂新購置系統之委外開發商應提供SBOM清單 (應含軟體構型項目、軟體組件、軟體單元及對應程式模組所建立之軟體結構化清單)，以揭露軟體組成成分及來源，提高風險管理透明度。然本次異常事件系統係於108年3月29日建置，中科院未依SBOM政策精神回溯清查，肇生管理破口，為本次事件待精進處。
中科院強調，已要求廠商提供完整SBOM，掌握系統服務功能，並重新檢討應變SOP；此外，要求於外網系統增設「異常資訊派送告警機制」及「服務網路強制暫停條件設定」(限流與自動封鎖) 等功能，不得僅依賴外網垃圾郵件觸發熔斷機制，俾早期預警及快速應變處置。後續將結合完整調查事證，究明管理疏失責任，並追蹤及落實改善措施執行情形。
1、中科院採購網是委民間廠商開發（是相當具名號及企業影響力採購網，只是因涉營業秘密不方便透露名號），架設於微軟的民網伺服器，所以此次攻擊並未影響本院官網及系統之運作。
2、中科院並未隱瞞當下狀況，確實當下刻正在執行AI agent資安訓練，故初始判斷為Agent逾越權限所肇生，直至外網因為遭入侵開啟隱藏程式功能，自行派送大量郵件，觸發系統預警熔斷機制，並提供報告予本院，始釐清肇案始末。
3、聯合報報導並未將本院提供之SBOM資訊背景及中科院前已針對新系統要求提供完整SBOM資訊完整報導，請媒體朋友可以Survey及瞭解有關美拜登政府發布SBOM要求之行政命令相關報導。
要調查駭客做了什麼，修補誠實說明的制度漏洞
專家質疑，所謂廠商為方便管理，內藏隱蔽排程管理介面，就是廠商私下留下了一個可以控制系統的「入口」。
「這個入口有沒有寫進契約？中科院知不知道？驗收時為什麼沒有發現？」專家並表示，如果中科院不知道，就是廠商私留「後門」；如果中科院知道卻沒有列管，就是中科院自己放任「後門」存在。
「境外IP破解並觸發排程，也不是一般程式錯誤。」專家強調，真正需要調查的是駭客如何進門、取得什麼權限、看過哪些資料，以及除了寄信以外還做過什麼。
專家並提醒，中科院從原本的「尚待調查」，到「AI Agent破解API」，又改口稱境外IP破解「後門」，並沒有回答駭客是否曾經查閱、下載或修改其他資料。
專家也稱，全案不能被淡化成「舊系統管理缺失」，中科院真正需要修補的，恐怕不只是程式漏洞，更是面對事故時，誠實說明的制度漏洞。
