行政院公布勞基法修法草案，勞動部長林美珠堅持此次修法是符合國際趨勢，既安全又保有彈性，不過仍有兩大爭議無法回應，而且這兩大爭議的責任一在資方，一在政府，所以外界與勞方把事主對準行政院，確實不是無的放矢。
問題一：勞資會議可以保障勞工嗎？
首先，勞動部提到修法有「四個不變」、「四個彈性」，主要是靠工會或勞資會議來做背書，意即若要調高加班上限、縮短輪班間隔時間等，都必須透過工會或勞資會議中的勞工代表同意。然而，台灣的工會組織率低是既成的事實，立委陳曼麗指出，企業及產業勞工的工會組織率在2010年達到14.6％，但近年來都維持在7％左右，農林漁牧業的組織率更低，就業者從2013年的54萬人，成長到2016年57.7萬人，但工會數始終只有9個。
陳曼麗舉例，美麗華工會成立前，資方舉行勞資會議，實施「四周變形工時」，最高可合法連續上班24天，工會成立後想重啟會議，卻礙於勞動部日前函釋，企業經勞資會議同意後，即使未來工會成立，也不再需要徵求工會同意，讓工會無能為力。對此，林美珠表示，依照規範，的確不用再徵求工會同意，只能呼籲勞資雙方「大家一起坐下來談。」
其實這樣的衝突，不只發生在美麗華工會，現行法規中，一旦勞資會議同意，即便原本的員工甲乙丙丁已經離職，員工ABCD仍必須遵守當時勞資會議的結果，也就是說，勞資會議的結論並沒有截止日，後來進入公司的員工，無法推翻先前勞資會議的結果，等於一紙結論，效期永遠。問題是，勞動部現在呼籲勞資坐下來談，但依然沒有任何具有約束力的規範。
問題二：勞檢量能不足
其次，監察院公布調查報告指出，台灣目前勞動檢查的覆蓋率僅有27.45%，以現有人力，不重複檢查的話，要檢查12年才檢查得完。台灣的勞檢員到底有多少人呢？到今年上半年，還不到1000人，實際進用員額僅716人，數量是全體勞工的1萬5千分之1，要到今年底才會陸續補到1000人。
時代力量立委黃國昌就引用財政部資料質詢指出，未具勞資會議同意加班的勞檢紀錄，全台僅查出5件，「僅有5件的勞檢紀錄真的反映了現實狀況嗎？還是根本沒有前往檢查。」黃國昌質疑，今年勞檢資料只有台北市有數據95件，另外五都都沒有看到，是勞檢沒有確切落實，林美珠回應說，其他五都資料還沒有送進來。
立委李彥秀查閱去年的勞檢年報後表示，去年勞動條件檢查6萬7194場次，僅占128萬家事業體的5%，其中高達1萬8183家違法勞基法，其中有6成5違規都與加班有關，重點是複查比例只有12%。李彥秀說，在勞檢不足的情況下，若還要修法，給予資方彈性，只是變相讓勞工過勞。林美珠則以「勞檢大概是最後手段，希望大家能自主遵守規定。」
顯然地，雖然行政院稱此次修法是為了增加勞資雙方的彈性，但會不會造成彈性疲乏呢？在過程中必須徵求勞工同意的勞資會議機制，在現行運作下已經有問題，而做最後把關的勞動檢查，也屢遭詬病，如果勞動部長只能「呼籲」、「期待」勞資好好坐下來談或是自主遵守規定，那麼也是此次修法被批評「大開資方後門」的原因之一，換句話說，在制度上若無法取得勞工信任，只會讓衝突越鬧越大。
