調查局調查員余正煌被PTT網友封為「勇於跟整個國家機器抗衡的男人」，他也在林智堅「論文門」爭議中，向台大學倫會說明，和公開信件資料。
事情演變至今，其實陳明通和林智堅是「唯二」看過余正煌論文的關係人，一位台大教授呼籲，這兩人不需要天天對外放話，應回到台大學倫會說明，尊重學校及教育部的審查結果。
一位台大教授指稱，經詢問民進黨桃園市長參選人林智堅的口試委員，並未看過余正煌的論文，而且余畢業在先；而林智堅在第一篇學位論文就是引用自余正煌，這顯示國安局長陳明通、林智堅是「唯二」看過余論文的關係人，有無抄襲「學倫會審查一翻兩瞪眼，演也沒有用。」
這位在學術與政界都有相當聲望的教授強調，台灣是法治國家，台大學倫會依法審查後，還要將結果提報到教育部進行初審和複審，要看最後審查結果，陳、林兩人不需要天天對外放話。
林智堅「論文門」爭議每日一爆。陳明通這個週末第三度發出千字聲明強調，是他先修正林的論文，再交給余正煌參考，沒有誰抄襲誰的問題，此一說法，遭到中研院院士、教育部前部長曾志朗以「胡說八道」來駁斥。
陳明通明顯失職，論文飄出套版味
對於陳明通的最新說辭，余正煌委任律師曾威凱表示，「會考慮以司法訴訟方式解決雙方紛爭，避免陷入無窮爭議。」另一位律師張祐齊則強調，「陳明通說的不是事實」、「完全沒這回事。」
「兩本論文長這麼像的，這一輩子還真沒看過！」這位台大教授驚嘆，從時序上來看，余正煌是在2016年7月口試通過，余根本看不到林智堅在2017年1月口試的論文。
「這兩本論文長這麼像，陳明通沒有請學生重新修改，這是明顯失職。」這位教授經比對兩本論文後稱，從第4頁的議題，研究結論都在第60頁，除了數據不同，可以高度懷疑是「整個套版」、很不可取。
特別是余正煌出席了台大「學術倫理審定委員會」進行說明，也公開授權台大調閱其碩士時期的學校信箱內部資料。
陳、林應回到學倫會說明，場外放話「仗勢欺人」
而陳明通和林智堅天天在「場外打球」放話，這位教授直言，陳、林是唯二看過余論文的人，卻不進入學倫會說明，這樣的做法「滿不道德」、「有點仗勢欺人」。
對於相同資料可否引用一事，這位教授強調，當然可以，但前提必須先註明出處，就不同議題進行實證，尋求新的發現。
這位教授再以陳明通的另外一位學生楊喜慧為例稱，楊喜慧採用了柯文哲和林智堅提供的民調資料，不但有註明出處，研究議題與迴歸分析方法都不相同；同時余正煌亦在論文中向楊喜慧表達謝意，林智堅反而完全沒有誌謝。
這位教授亦認為，林智堅的中華大學論文問題同樣很大，因為竹科報告的主持人為李友錚與王明郎；林智堅的指導教授賀力行並未參與，怎會會將竹科的委託研究案成果變成林的論文？
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特別是王明郎發表在中國北京一場研討論的英文版論文，台北市議員王鴻薇接獲檢舉稱，作著群並沒有列名林智堅，變成「一魚四吃」。
林智堅「論文門」幾乎天天都有新爆點，成了全民比對運動，再加上新竹棒球場事件衝擊，迄今演變成民進黨「全黨救一人」，更為年底選情埋下重大變數。
