有過去抗SARS的經驗，前疾管局局長、同時也是國內病毒免疫學權威的蘇益仁，在台灣仍關注每天確診數字如何、為零確診歡呼的同時，他是最早提出不該再期待「零本土」的專家。
2020年4、5月，蘇益仁不斷在媒體、公開場合呼籲政府要再追加疫苗，「因為秋冬疫情捲土重來，民眾會因恐慌心理去搶打疫苗，這是可預知的未來。」7月他也在新冠疫苗研發及緊急使用授權論壇中，強調疫苗發展要兼顧速度，「若疫苗明年3月才出來，但疫情是今年底11、12月來，這樣有什麼用？」
甚至在同年8月，美國衛生部長阿札爾（Alex Azar）訪台簽署醫衛合作備忘錄，卻未正面回應台灣當時最急迫的疫苗、藥物短缺問題，蘇益仁更直言，「如果美國無法解決台灣需求，阿札爾這次就白來了。」
談到近期熱議的傳染病是否降級問題，雖7月18日新任中央流行疫情指揮中心指揮官甫上任，被外界認為是為疫情降級做準備，不過蘇益仁在接受《信傳媒》專訪時表示，「其實4月底我就提出要降級，因為現在已經跟第5類傳染病不一樣了。」
目前仍把新冠肺炎放在第5類傳染病不降級，會產生哪些問題？
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4月底新冠就應從第5類降為第4類傳染病
蘇益仁提到，「從1918年的流感大流行到現在100多年，這個病毒不會消失，COVID-19死亡率只有2%，SARS有10%，但COVID-19是上呼吸道感染、傳播比較快速，SARS是下呼吸道感染，相對比較不容易傳播。」
他指出，這次Omicron疫情在經過歐美及亞洲今年初至今的經驗累積後，已了解確診者99%以上皆是輕症，在防疫及醫療上應以「輕症在家照護」為原則的輕重症分流策略應對。「卻發生快篩試劑嚴重不足，還有保險給付導致大量輕症病患湧入醫院急診做PCR，造成醫療體系負荷爆量，也衍生出有床位但醫護人力不足的窘境。」
而談到傳染病降級問題，蘇益仁表示其實4月底就提出新冠肺炎應降級，「因為這已經跟第5類傳染病不一樣了，而且2、3年來我們對新冠病毒已有一定的了解，現在輕症也佔99.5%以上，在科學學術上就更沒理由放在第5類。」
新冠降級才能解決急診塞爆、醫療崩潰問題
把新冠肺炎放在第5類傳染病，產生最大的問題在哪？
蘇益仁表示，除了防疫單位跟地方政府、民政單位的位階會高於基層防疫外，一般民眾染疫時仍要被隔離是最大的困擾。「如果降到第4級當成一般感染症的話，戴上口罩就可以簡單去外面買東西，是在家休息而不是在家隔離，也能回復到正常醫療體系，還是可以知道有多少人確診，因為如果發燒、喉嚨痛仍會去診所醫院拿藥，通報體系也不成問題。」
蘇益仁也提到，包括重症分流的部分，「一個傳染病怎麼會用重症醫療網在處理，變成醫學中心第一個收治，一週馬上就會爆滿，這是很大的問題。」
他強調，讓醫療體系、防疫體系放在重症通報跟治療隔離，可以集中重點治療，不需要再處理99.5%輕症的防疫。「我還不知道他們為什麼要這樣做，可能7月底指揮中心才要撤離，但隔離時候造成多少民眾不方便，旅遊業、經濟...各方面影響都很大。」
台大公衛學院教授陳秀熙也提到，倘若台灣無法從「大流行（第5類集中規範）」走向「地方流行（第4類社區監測）」，他推估在7至8月還有10-15%的超額死亡。
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民眾仍不敢不戴口罩 「好像戒嚴時期被政府馴化...」
蘇益仁也感慨，「到現在民眾都還是一直戴口罩，大家好像都在戒嚴時期一樣，人性的部分也用第5類傳染病被管制，政府把人民都馴化了。」
「我一直講科學防疫在這裡，COVID-19如果不會像SARS一樣消失，當遇到一個疫情如果傳染力很高，像Omicron就會守不住，而且會一直持續下去。」蘇益仁強調，當初設置《傳染病防治法》的用意是希望協助防疫，而非讓權利「獨大」，「Omicron跟Delta不一樣，檢疫天數早就應該從3+4變成0+7，一開始連接觸者都要，這樣根本關不完，疫情可以減災，但不可能圍堵。」
雖指揮中心宣布自7月19日起放寬戴口罩措施，「但沒有用更具體的理由講清楚，中央一句話大家就要執行，不執行就違法、被罰錢。當初我們制定《傳染病防治法》是為了必要時控制疫情，但合理情形下就應該要解放、要去溝通協調，這次沒有抓住好這個精神，後面的學術研究也沒有盡到能力，好幾方面都要檢討。」
7、8月後恐又再一波BA.4、BA.5流行
面對Omicron亞變種BA.4、BA.5，蘇益仁提到，「現在我一直在觀察，如果這2個傳染力比BA.2又快30%，我認為大概擋不住了，一定會發生，我們台灣也可能在7、8月後又再一波BA.4、BA.5流行，COVID-19不敢說幾乎不可能消失，但消失的可能性不大。所以你要決定防疫政策怎麼做，要不要清零、要不要邊境管制，這是一個科學的問題。」
在後疫情時代，蘇益仁認為這個時間點去做一個整體回顧是好的，「比如疫苗我覺得是最嚴重的，快篩也是大事；再來就是重症分流的部分，這些地方第一時間沒有做好，雖然後來有改善但都太慢了。」另外像是疫苗覆蓋率，他也強調其實不是看全民，主要還是著重在高危險族群的施打率，「長者投藥也一樣，給得太少太慢，如果當初早一點做，是不是會減少很多遺憾？」
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對於疫情以及長者的關注，以至於現在同時在開發阿茲海默症藥物、擔任美力齡生醫公司創辦人的蘇益仁說，「老實講我自己不太願意去管防疫的事，但想到曾經做過SARS時期疾管局局長、國衛院感染症疫苗研究所所長都做了那麼久，遇到百年大疫如果不提供一些專業意見，我良心也過不去。」
